Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TtlP38585 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TtlP38585 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TtlP38585 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms