Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PpargP37238 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PpargP37238 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PpargP37238 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PpargP37238 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PpargP37238 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms