Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn1P35821 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms