Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TpoP35419 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TpoP35419 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TpoP35419 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TpoP35419 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TpoP35419 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TpoP35419 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TpoP35419 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TpoP35419 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TpoP35419 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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TpoP35419 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TpoP35419 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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