Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc5P32043 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms