Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccnd3P30282 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms