Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msr1P30204 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms