Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Casp1P29452 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Casp1P29452 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Casp1P29452 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms