Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms