Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd10P28359 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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