Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb1P28230 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms