Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gjc1P28229 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gjc1P28229 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms