Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BrafP28028 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BrafP28028 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms