Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vav1P27870 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms