Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra3P26049 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms