Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RdxP26043 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RdxP26043 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RdxP26043 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RdxP26043 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RdxP26043 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RdxP26043 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RdxP26043 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms