Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NdnP25233 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NdnP25233 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NdnP25233 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NdnP25233 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NdnP25233 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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