Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf1bP25119 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf1bP25119 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf1bP25119 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms