Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkchP23298 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms