Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eif3aP23116 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms