Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms