Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gna11P21278 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms