Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BdnfP21237 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BdnfP21237 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms