Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkcaP20444 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms