Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms