Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfaP20033 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfaP20033 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms