Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NefhP19246 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NefhP19246 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NefhP19246 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NefhP19246 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NefhP19246 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NefhP19246 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NefhP19246 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms