Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Lama1P19137 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lama1P19137 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lama1P19137 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms