Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18528 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18528 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18528 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18528 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.5 ms