Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxb1P17919 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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