Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PcnaP17918 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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