Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou4f1P17208 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms