Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb3P17125 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms