Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf1P15314 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf1P15314 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Irf1P15314 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms