Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg5P12961 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms