Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntn1P12960 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn1P12960 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms