Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chrm1P12657 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chrm1P12657 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms