Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DmdP11531 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DmdP11531 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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DmdP11531 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DmdP11531 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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DmdP11531 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DmdP11531 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DmdP11531 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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DmdP11531 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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