Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PolP11369 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PolP11369 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PolP11369 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PolP11369 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP11369 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP11369 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms