Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P10404 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P10404 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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P10404 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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P10404 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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P10404 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P10404 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P10404 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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