Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb4P10284 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb4P10284 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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