Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp28P10078 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp28P10078 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp28P10078 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp28P10078 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp28P10078 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp28P10078 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms