Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calm3P0DP28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calm3P0DP28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Calm3P0DP28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms