Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd7P0C872 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd7P0C872 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms