Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms