Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Egr1P08046 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Egr1P08046 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Egr1P08046 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Egr1P08046 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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