Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TnfP06804 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms