Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms