Protein–RNA interactions for Protein: P04247

Mb, Myoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MbP04247 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MbP04247 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MbP04247 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MbP04247 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms