Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2-Eb1P04230 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-Eb1P04230 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms